石清水八幡宮境内は，八幡神（はちまんしん）を祭神として平安時代に創建された，我が国を代表する神社境内であり，淀川左岸の標高約１２０ｍの男山（おとこやま）丘陵に立地する。その創始は，貞観（じょうがん）元年（８５９），僧行教（ぎょうきょう）が宇佐八幡宮（うさはちまんぐう）で受けた神託に従い，山城国（(やましろのくに）男山山頂に八幡大菩薩（はちまんだいぼさつ）を勧請（かんじょう）したものとされる。天慶（てんぎょう）２年（９３９）には伊勢神宮に次いで奉幣（ほうへい）される地位を得，天下第二の宗廟（そうびょう）と称された。天皇・上皇の一代一度の参詣（さんけい）も慣行となり，藤原氏の参詣も相次ぐなど，朝廷・貴族の厚い崇敬を受けた。
　また，武家の棟梁（とうりょう）として台頭してきた源氏に厚く信仰され，鎌倉・鶴岡八幡宮（つるがおかはちまんぐう）を代表として八幡神は各地に勧請されその信仰が広まった。
　創始当初から廃仏毀釈（はいぶつきしゃく）まで神仏習合（しんぶつしゅうごう）の宮寺（ぐうじ）の形態をとり，境内には寺院施設，社僧（しゃそう）の坊が多数設けられていた。八幡市教育委員会による発掘調査によって，護国寺や坊舎（ぼうしゃ）などの遺構が良好に残っていることが確認されている。
　古代以来の神社境内の趣きを今に伝えるとともに，神仏習合の宮寺として坊舎などの遺構も良好に残り，我が国の宗教史を理解する上で重要である。