桜堂薬師仁王門は、瑞浪市のほぼ中央に位置する土岐町桜堂地区に所在し、桜堂薬師本堂の南西約100ｍに位置する。桜堂薬師は、弘仁３年（812）に瑞桜山法妙寺（法明寺）として創建されたとされる天台宗の寺院で、元亀２年（1571）に織田信長の命を受けた森長可によって焼き打ちに遭い、古記録や本堂、多くの坊院を失ったとも伝えられる。
仁王門の建立年代は明らかでなく、土岐氏に関連する寺院、あるいは屋敷から移築されたとも伝えられる。その伝承の真否は判断できないが、寛文５年（1665）に描かれた絵図に当該仁王門が描かれていることから、この時点には現在地に建立されていたとみられる。建立当時の屋根形状及び葺材は明らかでないが、寛文５年（1665）年頃には切妻造、桧皮葺き、あるいは杮葺きであったことが上記絵図から知られる。その後、江戸時代中期に萱葺きに、寛延３年（1750）に本瓦葺きに改められたことが棟札および鬼瓦の刻銘から知られ、現在の屋根は平成20年の修復によるものである。