金林寺は，高知県東部の山間部にあり，高野山真言宗に属する。創立は平安時代後期に遡ると考えられ，地域の信仰の拠点であった。
　桁行３間，梁間４間で，内部は外陣と内陣からなる。屋根は寄棟造，銅板葺で，建築細部は室町時代中・後期の様式をよく示している。
　内部にある厨子は，露盤天板裏面の墨書から永正15年(1518)のものと判明する。
　金林寺薬師堂は垂木を用いず板軒とする珍しい手法で，優美な外観をもち，簡素ながら檜，杉の良材を用いた上質なつくりに特徴がある。
　四国中・南部において16世紀初頭以前に遡る数少ない例として貴重であり，この地域の建築文化の成熟を示す遺構として，価値が高い。