旧島津氏玉里邸は、島津家第２７代当主島津斉興によって天保６年（1835）に造営されたといわれる。
斉興没後は養女勝姫が居住していたが、明治１２年(1877)の西南戦争の兵火により消失した。この時、北側の長屋門が焼失を免れたというが明らかでない。斉興の子久光は明治１０年１１月に玉里邸の再築を命じ、明治１１年１１月には玉里邸に入り自ら工事を指揮、翌１２年３月に上棟式を挙行した。久光によって再築された玉里邸は、太平洋戦争中の昭和２０年（1945）年７月１９日に戦災を蒙り、西側の茶室と庭園、南側の正門及び北側の長屋門とその付近の建物を残して消失したとされる。その後、昭和２６年（1951）に鹿児島市が玉里邸を買収。昭和３２年１０月に鹿児島女子高等学校の校舎が建設されることになり、同３４年４月に天保山から全校移転した。長屋門は昭和６１年の校舎増築に先立って、前年の昭和６０年に移設工事が行われた。この工事で長屋の一部は元の位置に残し（現在の体育倉庫）、門と周辺部分については１８０度転換して現在の位置に移設された。なお、移設されなかった部分については撤去されたとみられる。